A MM está tem sua matriz sediada em Salvador, onde centraliza sua gestão administrativa, financeira e operacional para atender suas demandas recursos humanos, compras, pagamentos, projetos e controle técnico-operacional.
Em cada cidade onde presta serviços de limpeza urbana, a MM possui unidade própria para a distribuição e execução de suas atividades. Em cada uma dessas sedes, em conformidade com as NRs 18 e 24 do Ministério do Trabalho, há instalações administrativas e operacionais adequadas para atender as demandas dos serviços prestados no município, sendo providas de escritórios, recepção, espaços para controle de freqüência e atendimento aos colaboradores, área de convivência, pátio de estacionamento, almoxarifados, vestiários e sanitários, etc.